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《细胞》:针对致命肺癌 迄今最详细分子地图指出多条治疗道路

   2021-08-11 15:25:18 学术经纬5680
核心提示:这项研究中,来自Broad研究所等多家机构的研究人员,对肺鳞癌展开了蛋白基因组学(proteogenomic)研究,即利用基因组学、转录组学、蛋白质组学以及成像和临床数据,为肺鳞癌绘制出迄今最全面的分子图谱。

近日,顶尖学术期刊《细胞》发表了一项关于肺癌的研究,对目前治疗选择少、致死率高的一类肺癌——肺鳞状细胞癌(简称肺鳞癌,LSCC)的生物学基础进行了深入阐述,为攻克这类癌症找出多个潜在的新药靶点,以及有助于提高免疫疗法效果的调节途径。


这项研究中,来自Broad研究所等多家机构的研究人员,对肺鳞癌展开了蛋白基因组学(proteogenomic)研究,即利用基因组学、转录组学、蛋白质组学以及成像和临床数据,为肺鳞癌绘制出迄今最全面的分子图谱。


这项研究的数据目前已可以通过美国国立卫生研究院(NIH)的相关网站免费获取:https://proteomics.cancer.gov/data-portal。


研究团队搜集了108例肺鳞癌在治疗前的肿瘤组织,分析了其中的DNA、RNA、蛋白质和蛋白质的转录后修饰(如磷酸化、乙酰化、泛素化等),并与99份癌旁正常组织的样本进行了比较。



▲研究示意图(图片来源:参考资料[1])


研究人员指出,过去针对肺鳞癌的不少临床试验都失败了,通过更深入地了解这种癌症的生物学基础,将揭示治疗肺鳞癌的新机会。例如,FGFR1是肺鳞癌中经常出现扩增的一个基因,然而先前直接针对FGFR1的试验未能取得成功,而这项研究显示,基因NSD3可能是FGFR1扩增型癌症中肿瘤的关键驱动因素,可作为潜在的治疗靶点。


还有一部分p63低表达的肿瘤,显示出生存素(survivin)高表达。后者是一种调节细胞增殖和死亡的蛋白质,已在其他类型肿瘤的临床试验中作为治疗目标,可以作为治疗肺鳞癌的潜力靶点。


数据还表明,针对调节染色质的LSD1和EZH2这两个靶点,有利于治疗转录因子SOX2过表达驱动的肿瘤。这一结果意味着,对于本身常被认为是“不可成药”靶点的SOX2,可以另辟蹊径。


除了上述潜在药物靶点外,蛋白基因组学还提供了许多与免疫相关的数据,为探索更好的免疫疗法指出方向。研究人员提到,尽管免疫疗法在过去几十年里造福了很多肺癌患者,但对于肺鳞癌患者来说,只有少数表现出长期反应。


其中一些数据突出了某些肿瘤与响应免疫检查点抑制剂(例如PD-1抑制剂)、免疫逃避有关的生物标志物,为理解不同肺腺癌患者对免疫疗法有不同的预后提供了一些线索。


这项研究的另一个重要发现是新的肺鳞癌分子亚型。先前通过基因组学,科学家们已经确定了肺腺癌的四种分子亚型,分别对应不同的细胞类型和发展过程。而蛋白基因组学的研究,不仅进一步揭示了这些亚型相关的免疫、代谢和增殖信号,还发现了一种被称为“上皮-间质细胞转化”(EMT)的新亚型。这种新亚型可能更容易发生转移,但激酶驱动的分子通路也暴露了可以用来治疗的药物靶点。


此外,研究数据还对肺鳞癌的疾病机制提出了新的洞见,显示出泛素化、磷酸化、乙酰化等代谢途径失调和相互干扰,与驱动肿瘤发生的关系。



(图片来源:参考资料[1])


注:原文有删减


参考资料


[1] Shankha Satpathy et al., (2021) A proteogenomic portrait of lung squamous cell carcinoma. Cell. Doi: https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.07.016


[2] A more complete molecular picture of lung squamous cell carcinoma comes into view.


Retrieved Aug. 9, 2021 from https://www.eurekalert.org/news-releases/924409

 
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