Science新研究追溯乙肝病毒从史前到现在的进化过程

在一项新的研究中，来自德国、俄罗斯和西班牙等多个国家的研究人员通过分析迄今为止产生的最大的古代病毒基因组数据集，揭示了自全新世早期以来乙型肝炎病毒（HBV）的演变。相关研究结果发表在2021年10月8日的Science期刊上，论文标题为“Ten millennia of hepatitis B virus evolution”。

HBV是世界范围内的一个主要健康问题，每年造成近一百万人死亡。最近的古代DNA研究表明，HBV感染人类已经有几千年的历史，但是它过去的多样性和传播路线在很大程度上仍然是未知的。这项新的研究通过检查137个可追溯到~10,500年前和~400年前之间的古代欧亚人和美洲原住民的病毒基因组，对HBV的进化历史提供了重要的新见解。他们的研究结果突出了HBV的传播路线和病毒多样性变化，反映了众所周知的人类迁移和人口事件，以及意想不到的模式和与现在的联系。

HBV与美洲的人口居住

现今的HBV毒株被分为九种基因型：基因型A、B、C、D、E、F、G、H和I，其中的两种基因型主要存在于美洲原住民的人群中。该研究提供了强有力的证据，证明这两种基因型的HBV毒株来自一个HBV谱系，该谱系在更新世末期左右分化，并由美洲的一些首批居民携带。

史前欧洲的HBV

这项研究还显示，早在1万年前，即农业传播到欧洲大陆之前，该病毒就已经出现在欧洲的大部分地区。

乙型肝炎病毒(HBV)基因组及其重叠开放阅读框和转录本的示意图，图片来自Front. Microbiol., 18 July 2018，doi:10.3389/fmicb.2018.01611

在欧洲新石器时代过渡之后，狩猎采集者携带的HBV毒株被新的毒株所取代，这些新的毒株可能由欧洲大陆的第一批农民传播，这反映了与整个地区农业群体的扩张有关的大量基因流入情况。这些新的病毒谱系在整个欧亚大陆持续了近4000年。这些毒株的主导地位一直持续到5000年前左右西部草原牧民的扩张，这极大地改变了欧洲人的遗传特征，但值得注意的是，这与新的HBV变体的传播无关。

史前HBV的崩溃和重新出现

这项研究最令人惊讶的发现之一是，在公元前二千年的后半段，欧亚大陆西部的HBV多样性突然下降，这是一个重大的文化转变时期，包括地中海东部地区大型青铜时代国家社会的崩溃。

这一时期之后在欧亚大陆西部发现的所有古代HBV毒株都属于新的病毒谱系，这些病毒谱系今天仍然在该地区流行。然而，与该地区以前的史前多样性有关的一个变体似乎一直持续到现在。这个史前变异体已经演化成一种罕见的基因型---基因型G，似乎是最近在HIV大流行期间出现的，其原因尚待了解。

注：原文有删减

参考资料：

Arthur Kocher et al. Ten millennia of hepatitis B virus evolution. Science, 2021, doi:10.1126/science.abi5658.