Cell：单碱基编辑技术，成功修复重症免疫缺陷的基因突变，恢复T细胞产生

CD3δ重症联合免疫缺陷（CD3δ-SCID）是一种罕见且致命的遗传性免疫缺陷疾病，由CD3δ基因的C→T单碱基突变所致，这一突变导致终止密码子提前， CD3δ蛋白的翻译被提前终止，而CD3δ蛋白是血液干细胞正常发育为T细胞所必需的。

患有CD3δ-SCID的婴儿缺乏T细胞，因此在出生后无法抵抗感染，如果不治疗，他们通常在出生后两年内死亡。目前，骨髓移植是治疗这种疾病的唯一可行的方法，但众所周知，骨髓配型非常困难，而且骨髓移植这一过程对于CD3δ-SCID婴儿来说也充满风险。

2023年3月20日，加州大学洛杉矶分校  Donald Kohn 实验室在 Cell 期刊发表了题为： Human T cell generation is restored in CD3δ severe combined immunodeficiency through adenine base editing 的研究论文。

这项研究表明， 碱基编辑 （base Editing） 技术可一次性治疗罕见而致命的遗传疾病—— CD3δ重症联合免疫缺陷 （CD3δ-SCID） 。他们使用腺嘌呤碱基编辑器 （ABE） 纠正了患者造血干细胞和祖细胞（HSPC）中CD3δ基因的致病单碱基突变，从而恢复了 血液干细胞产生T细胞的能力 ，为CD3δ-SCID患者带来了一次性治疗新选择。

Donald Kohn 教授实验室此前曾成功开发过几款免疫缺陷疾病的基因疗法，包括其他类型的重症联合免疫缺陷 （SCID） ，这一次，他们把目光放在了CD3δ-SCID上，希望为这种疾病的患者找到更好的治疗选择。

而这一次，他们选择了实验室之前从未尝试过的新技术——碱基编辑。碱基编辑是由刘如谦 （David Liu） 团队开发的新一代基因编辑技术，能够在不引起DNA双链断裂的情况下修复单碱基突变，因而被认为比CRSIPR-Cas9技术更安全、更精准。

研究团队与碱基编辑技术的开创者刘如谦教授合作，选择了腺嘌呤碱基编辑器（ABE），ABE能够催化A·T→G·C的转换，从而修复CD3δ-SCID患者的致病突变，研究团队对正在接受骨髓移植的CD3δ-SCID患者捐献的造血干细胞和祖细胞 （HSPC） 进行研究。

研究团队将编码实验室进化版本的ABE的mRNA和gRNA递送到CD3δ-SCID患者捐献的造血干细胞和祖细胞（HSPC）中，实验结果显示， 平均修复了71%的致病基因突变。

接下来，研究团队与加州大学洛杉矶分校的 Gloria Yiu 博士合作，测试经过ABE修复的HSPC细胞是否能产生T细胞。Gloria Yiu 博士使用了  Gay Crooks 实验室开发的人工胸腺类器官 （Artificial Thymic Organoids，ATO） 进行研究，这种人工胸腺类器官能够模拟人类胸腺环境，胸腺是血液干细胞分化为T细胞的场所。

实验结果显示，ABE修复的HSPC细胞被引入人工胸腺类器官后，产生了功能完全且成熟的T细胞。这表明了对CD3δ-SCID患者的干细胞进行碱基编辑可以修复他们的致病基因突变。

最后，研究团队将这些ABE修复后的HSPC细胞移植到免疫缺陷小鼠体内以研究它们的寿命，结果显示，这些碱基编辑后的细胞在移植后四个月时仍然存在，这表明经过碱基编辑的HSPC细胞可以长期存在，并产生了正常免疫系统功能所需的T细胞。

这项研究充分展现了团队科学之美，将临床需求与科学专业知识相结合，为患者带来了新的、更具潜力的治疗选择。据悉， 研究团队正在进一步探索将这种新方法应用于CD3δ-SCID婴儿的临床试验。